渔用药物主要是用来杀灭病原体达到防治鱼类疾病的目的，但是，药物（主要指外用药物）进入水体后，在杀灭水体中的病原体时，往往同时也杀灭了水体中的一些浮游生物，使水体的光合作用减弱，同时杀死的浮游植物发酵会耗氧；而药物在分解或溶解过程中，也会使水体的各项水化指标有所改变，暂时打破了水体现有的平衡；再加上药物本身对鱼体有一定的刺激作用，从而使鱼体处于一种应激状态下来适应新的环境。