对养殖鱼类，能直接或间接地造成危害的生物。在鱼类养殖中，敌害的防治也是非常重要的。常见的敌害有藻类、软体动物、甲壳动物、昆虫和其他动物等。
藻类
为害的有蓝藻、绿藻和金藻。常见的蓝藻为微囊藻（Microcystis），主要有铜绿微囊藻（M.ae-ruginosa）和水花微囊藻（M.flosaquae）。藻体胶质膜，鱼吃了不易消化。藻体死亡后分解产生烃胺（NH2OH和硫化氢等有毒物质，能使鱼中毒死亡。水温28～30℃和pH值8～9.5，微囊藻大量繁殖时，水面常出现一层草绿色的水华，俗称湖淀。用0.7毫克/升硫酸铜全池遍洒，可杀死。
常见的绿藻为水绵（Spirogyra）、双星藻（Zygne-ma）、转板藻（Mougeotia）以及水网藻（Hydrodictyon reticulatum），在池塘里大量繁殖时，会形成团絮状和网眼状的藻群，幼鱼误入，即被缠住，以致死亡。与此同时，池中养料消耗殆尽，水变清瘦，会影响鱼的生长，造成鱼苗及早期夏花鱼种的死亡。用生石灰清塘可预防。用0.7毫克/升硫酸铜遍洒，可杀死。
已知的有害金藻为三毛金藻（Prymnesium）。此藻喜欢生长在盐度3‰～5‰以上和氯化物含量2000毫克/升以上的水体中。中国自70年代以来，先后在辽宁、内蒙古、宁夏、陕西、河北、天津、浙江和广东等地发现三毛金藻能分泌溶血素和鱼毒素。当它在水中的密度超过3000万个/升时，水呈浓黄褐色，能使鱼中毒大量死亡。所有饲养鱼类都会受害，但以鲢、鳙最为敏感。
鱼中毒后向池的四隅集中，中毒严重时，几乎所有的鱼聚集于池岸边附近水面。一般头向
在中国发现的三毛金藻有两种：舞三毛金藻（P.saltana）和小三毛金藻（P.parvum）。也有认为两者是同物异名。
用5毫克/升硫酸铵，每星期施放1次；或每星期用1～1.5千克尿素和2～3千克过磷酸钙促进其他浮游生物繁生，能起到抑制三毛金藻繁殖的作用。中毒的鱼池可换池或灌注清水，以减轻病情的发展。
软体动物
蚌、螺类的大量繁殖，会与饲养的鱼苗、鱼种争夺食料、营养，并大量消耗溶氧，对幼鱼生长不利。螺、蚌类还是鱼的某些蠕虫病的传播者。如蚌的钩介幼虫（见图）在繁殖季节（6～7月）常附在鱼的体表及鳃上
