施药方法有口服法（内服法）、遍洒法（泼洒法）、浸泡法、注射法、涂抹法和挂篓（袋）法等，选择给药途径时应考虑以下四个因素：
1、患病动物的生理、病理状况
对于患病严重的鱼池，病鱼停止摄食或很少摄食时，应选择全池遍洒、浸泡法等给药方法，使用投喂法（内服法、下同）一般无效；一些体表患有溃疡、伤口感染等病灶的，特别是亲鱼、龟、鳖、蛙类，可用涂抹法给药。
2、病原体的种类
由细菌、病毒和体内寄生虫引起的鱼病，可用口服法、挂袋（篓）法、全池遍洒法、浸泡法给药；由体表寄生虫引起的鱼病，可用全池遍洒法、浸泡法给药。
3、药物的理化性质与类型
不同药物的水溶性不同，除杀虫药物外，能溶于水或经少量溶媒处理后就能溶于水的药物，可采取拌饵口服投喂法、全池遍洒法、浸泡法、挂袋（篓）法；杀虫类药物可用全池遍洒、浸泡法、挂袋（篓）法；疫苗、亲鱼催产激素的使用可采用注射法（疫苗还可根据免疫对象选用浸泡法、喷雾法甚至口服法）。
4、水产动物生态习性
甲壳类动物(如虾蟹等)在蜕壳过程中和刚蜕壳后的动物体质较弱，一般不宜用药，尤其对毒性大的渔药，如硫酸铜、福尔马林等更应慎用。
对于带有“包壳”保护层的小瓜虫、粘孢子虫和锚头蚤之类的虫害，最好在它们生活周期中的尚未依附寄主时或者离开寄生、活动在自然水体的生存阶段用药最好，因为这个时候是它们的药物敏感时期，才有更有较好的杀灭作用。
在混养池塘中使用渔药时，不仅要注意患病对象的安全性，同时也要考虑选择的药物对未患病的种类是否安全。另外，还要注意不同养殖种类、年龄和生长阶段的水生动物对渔药敏感的差异性。
