养殖鱼在不同生长阶段偏爱的颜色也可能不一样。深色水箱通常更适合仔鱼，因为它们需要捕食浮游生物，而在深色背景的水箱中更容易观察到浮游生物的位置。
在研究涉及到的所有品种的仔鱼中，最受欢迎的是黑色，其次是没有颜色偏好，第三是蓝色。一些品种的成鱼更喜欢蓝色和白色，但也有许多品种的成鱼并没有偏爱的颜色。浅色的水箱通常会增加鲑鱼、鳟鱼的侵略性，让它们变得更容易受伤或生病。
某些颜色的水箱则会导致鱼的皮质醇水平升高，皮质醇是测量动物压力激素的指标，皮质醇增多可能导致养殖鱼生长减缓、更有侵略性。但皮质醇上升也能使鲑鱼早熟，缩短鲑鱼养殖周期。
另外，消费者常常根据鱼的外部颜色和图案来判断鱼的好坏，因此养殖户可选择用某种颜色的水箱进行养殖，确保鱼的外表更受消费者喜爱。
