鲫鱼孢子虫主要寄生于鱼类，鲫鱼鱼苗和成鱼受孢子虫影响较为严重，以6月份~8月份最为严重。发病池塘感染率高，死亡率高达80%，甚至会导致死绝。鲫鱼感染孢子虫初期无任何症状，很难发现，只有通过镜检才能发现，一旦孢子虫在鲫鱼身上开始寄生，肉眼就能看得出来，病鱼体色发黑，呼吸困难，鱼体瘦弱，吃食能力差，离群独游，反应迟钝，最终濒临死亡。